Иако механички водомери нуде многе предности, они такође имају нека ограничења:
1. Ограничена тачност: Тачност механичких водомера зависи од брзине протока воде и прецизности њихових механичких компоненти. Када је проток воде низак, тачност механичких водомера се смањује.
2. Обавезно ручно очитавање: Механички водомери захтевају ручно очитавање, што захтева време и труд.
3. Без аутоматизованог управљања: Пошто механички водомери не могу да очитају аутоматски, аутоматизовано управљање није могуће. Очитавања бројила се морају бележити ручно у сврху управљања.
